PISTILLAIRE rime avec "Saint Hilaire" [l], ce qui est d'ailleurs le cas des vingt mots en -ILLAIRE, à l'exception notable de FIBRILLAIRE (de FIBRILLE) qui, conformément à sa graphie en "ill", rime avec "brillèrent" [j].
Tout semble assez logique. Par exemple, MAXILLAIRE, emprunté au latin maxillaris, se prononce [l], tout comme MAXILLE [l]. (En latin "ll" se prononce [l-l] et pas [j].)
De même PUPILLAIRE, emprunté au latin pupillaris, se prononce [l] alors qu'il signifie relatif à l'orphelin, au PUPILLE [j].
La question qui me taraude : pourquoi PISTILLAIRE prend-il deux L alors qu'il est un dérivé de PISTIL et qu'il n'est pas emprunté à un mot latin du style pistillaris ? S'agit-il d'un hommage au latin pistillus "pilon", d'où provient PISTIL ?
Remarque : les mycologues emploient le terme pistillaris "en forme de pilon" dans le nom binomial de plusieurs champignons en forme de pilon, dont Podaxis pistillaris.